• EMMA – Eesti Mälu ja Migratsiooni Andmestu on Eesti Mälu Instituudi hallatav avalik andmestu, koondab teavet ligikaudu 175 tuhande Eesti inimese kohta, neist umbes 90 tuhat on Nõukogude okupatsioonivõimu ohvrid ning 70 tuhat Teise maailmasõja ajal kodumaalt põgenenud. Andmed pärinevad eri riikide arhiividest ja publitseeritud materjalidest ning on esitatud allika põhiselt.
  See on asendamatu tööriist nii ajaloolastele kui ka suguvõsauurijatele, võimaldades detailseid otsinguid inimeste saatuse kohta. EMMA andmed on dubleeritud Eesti kommunismiohvrite e-memoriaalis ning Eesti sõjapõgenike andmebaasis.
• Kommunismiohvrite andmebaas. Andmebaasi kantakse aastatel 1940-1991 Nõukogude Liidu okupatsioonivõimu poolt kohtuväliselt represseeritud või alusetult süüdimõistetud ning vastavalt Eesti Vabariigi seadusele kohtuväliselt represseeritud ja alusetult süüdimõistetud isikute rehabiliteerimise kohta rehabiliteerimisele kuulunud isikud. Lisaks sisaldab andmebaas: vahetu kommunistliku terrori käigus hukkunud isikuid; kannatanuid, kes vangistusest või asumiselt vabanesid; küüditamisele kuulunuid, kuid keda ei küüditatud ja neid, kelle saatus on teadmata.
• Rahvuskaaslased Saksa koonduslaagrites – andmebaas. Andmekogu Teise maailmasõja ajal 1941-1944 Saksamaal ja okupeeritud Poolas asunud koonduslaagritesse saadetud Eesti elanikest. Tööd andmekoguga alustasid 2007-2008 Tartu Ülikooli ajaloo ja arheoloogia instituudi arhiivinduse osakonna ja Eesti Mälu Instituudi töötajad ning selle viis lõpule 2013-2014 Eesti Mälu Instituut. Valminud andmebaas sisaldab Eesti Riigiarhiivis, Stutthofi koonduslaagri arhiivis ja Rahvusvahelises Otsimiskeskuses tuvastatud teavet. Uurimistööd on toetanud Haridus- ja Teadusministeerium ja Rahvusarhiiv Rahvuskaaslaste programmi raames.
• 1941-1944 Eestis hukatud ja vanglates hukkunud Eesti inimesed Nimekiri sisaldab andmeid Saksa okupatsioonivõimude repressioonides hukkunud isikute kohta.
• 1941-1944 mõrvatud Eesti juudid Nimekiri sisaldab andmeid holokausti käigus mõrvatud Eesti juutide kohta.
• Eesti sõjapõgenikud Teises maailmasõjas Eesti Mälu Instituut alustas 2022. aastal Teise maailmasõja kestel Eestist põgenenud isikute andmekogu koostamist. Töö esimeses etapis keskendutakse eelkõige esmastele sihtriikidele, kuhu põgenikud suundusid: Rootsi ja Saksamaale.