• EMMA– Eesti Mälu ja Migratsiooni Andmestu
• Kommunismiohvrite andmebaas. Andmebaasi kantakse aastatel 1940-1991 Nõukogude Liidu okupatsioonivõimu poolt kohtuväliselt represseeritud või alusetult süüdimõistetud ning vastavalt Eesti Vabariigi seadusele kohtuväliselt represseeritud ja alusetult süüdimõistetud isikute rehabiliteerimise kohta rehabiliteerimisele kuulunud isikud. Lisaks sisaldab andmebaas: vahetu kommunistliku terrori käigus hukkunud isikuid; kannatanuid, kes vangistusest või asumiselt vabanesid; küüditamisele kuulunuid, kuid keda ei küüditatud ja neid, kelle saatus on teadmata.
• Rahvuskaaslased Saksa koonduslaagrites – andmebaas. Andmekogu Teise maailmasõja ajal 1941-1944 Saksamaal ja okupeeritud Poolas asunud koonduslaagritesse saadetud Eesti elanikest. Tööd andmekoguga alustasid 2007-2008 Tartu Ülikooli ajaloo ja arheoloogia instituudi arhiivinduse osakonna ja Eesti Mälu Instituudi töötajad ning selle viis lõpule 2013-2014 Eesti Mälu Instituut. Valminud andmebaas sisaldab Eesti Riigiarhiivis, Stutthofi koonduslaagri arhiivis ja Rahvusvahelises Otsimiskeskuses tuvastatud teavet. Uurimistööd on toetanud Haridus- ja Teadusministeerium ja Rahvusarhiiv Rahvuskaaslaste programmi raames.
• 1941-1944 Eestis hukatud ja vanglates hukkunud Eesti inimesed Nimekiri sisaldab andmeid Saksa okupatsioonivõimude repressioonides hukkunud isikute kohta.
• 1941-1944 mõrvatud Eesti juudid Nimekiri sisaldab andmeid holokausti käigus mõrvatud Eesti juutide kohta.
• Eesti sõjapõgenikud Teises maailmasõjas Eesti Mälu Instituut alustas 2022. aastal Teise maailmasõja kestel Eestist põgenenud isikute andmekogu koostamist. Töö esimeses etapis keskendutakse eelkõige esmastele sihtriikidele, kuhu põgenikud suundusid: Rootsi ja Saksamaale.